中药创新研究所秉承中西医结合的科研思路，在中医药理论指导下，应用现代科技手段，开展中药药效物质基础研究，建立多成分评价中药品质方法，为研究院的中药新药开发提供“安全、有效、稳定、可控”的质量控制体系；并积极服务医药企业，促进科研成果转化。
本研究所已发表学术论文215篇，其中SCI收录42篇；出版《中药化学》（英文版）、《天然药物化学》、《中药材安全和监控》等9部国家创新规划教材和论著；中标国家自然科学基金等各类科研项目30项，授权国家发明专利3项；获得福建省科学技术进步奖3项，其中二等奖1项，三等奖2项，研究成果已在省内相关企业得到推广应用。
研究内容
1、经方名方的创新中药研发。
2、中药及中药复方药效物质基础研究。
3、福建道地药材质量标准及品质评价研究。
4、药物剂型的评价与研究。